MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 108585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019738	AAAT	2	8	39247	39254	75 %	25 %	0 %	0 %	428308406
502	NC_019738	GGT	2	6	39280	39285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308406
503	NC_019738	GCT	2	6	39532	39537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308406
504	NC_019738	CAT	2	6	39573	39578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308406
505	NC_019738	GCT	2	6	39688	39693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308406
506	NC_019738	CTACG	2	10	39701	39710	20 %	20 %	20 %	40 %	428308406
507	NC_019738	ATTG	2	8	39803	39810	25 %	50 %	25 %	0 %	428308406
508	NC_019738	CAA	2	6	39842	39847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308406
509	NC_019738	CGC	2	6	39861	39866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308406
510	NC_019738	GAC	2	6	40044	40049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308406
511	NC_019738	AG	3	6	40101	40106	50 %	0 %	50 %	0 %	428308406
512	NC_019738	AT	3	6	40139	40144	50 %	50 %	0 %	0 %	428308406
513	NC_019738	AGT	2	6	40198	40203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308406
514	NC_019738	CAG	2	6	40206	40211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308406
515	NC_019738	GCT	2	6	40308	40313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308406
516	NC_019738	C	6	6	40604	40609	0 %	0 %	0 %	100 %	428308407
517	NC_019738	CTT	2	6	40614	40619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308407
518	NC_019738	AGC	2	6	40791	40796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308407
519	NC_019738	TGT	2	6	40836	40841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308407
520	NC_019738	TGG	2	6	40883	40888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308407
521	NC_019738	ATA	2	6	40946	40951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308407
522	NC_019738	GTC	2	6	40988	40993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308407
523	NC_019738	TCT	2	6	40998	41003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308407
524	NC_019738	TG	3	6	41023	41028	0 %	50 %	50 %	0 %	428308407
525	NC_019738	TTC	2	6	41055	41060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308407
526	NC_019738	TGT	2	6	41121	41126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308407
527	NC_019738	C	7	7	41183	41189	0 %	0 %	0 %	100 %	428308407
528	NC_019738	TGA	2	6	41283	41288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308408
529	NC_019738	CCG	2	6	41424	41429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308408
530	NC_019738	TGC	2	6	41478	41483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308408
531	NC_019738	TGT	2	6	41487	41492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308408
532	NC_019738	GGAGT	2	10	41502	41511	20 %	20 %	60 %	0 %	428308408
533	NC_019738	CTT	2	6	41521	41526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308408
534	NC_019738	AAT	2	6	41603	41608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308408
535	NC_019738	CG	3	6	41620	41625	0 %	0 %	50 %	50 %	428308408
536	NC_019738	C	6	6	41674	41679	0 %	0 %	0 %	100 %	428308408
537	NC_019738	GGA	2	6	41715	41720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308408
538	NC_019738	TGC	2	6	41847	41852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308408
539	NC_019738	AGAT	2	8	41856	41863	50 %	25 %	25 %	0 %	428308408
540	NC_019738	AAT	2	6	41886	41891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308408
541	NC_019738	CATG	2	8	41992	41999	25 %	25 %	25 %	25 %	428308408
542	NC_019738	CAT	2	6	42070	42075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308408
543	NC_019738	ACA	2	6	42106	42111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308408
544	NC_019738	GTT	2	6	42117	42122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308408
545	NC_019738	TCT	2	6	42129	42134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308408
546	NC_019738	CCT	2	6	42289	42294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308408
547	NC_019738	CAA	2	6	42296	42301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308408
548	NC_019738	CAT	2	6	42302	42307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308408
549	NC_019738	GCG	2	6	42315	42320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308408
550	NC_019738	TG	3	6	42350	42355	0 %	50 %	50 %	0 %	428308408
551	NC_019738	CTTT	2	8	42370	42377	0 %	75 %	0 %	25 %	428308408
552	NC_019738	ACG	2	6	42593	42598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308409
553	NC_019738	CATTG	2	10	42630	42639	20 %	40 %	20 %	20 %	428308409
554	NC_019738	GAC	2	6	42723	42728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308409
555	NC_019738	TGAG	2	8	42809	42816	25 %	25 %	50 %	0 %	428308409
556	NC_019738	CTA	2	6	42875	42880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308409
557	NC_019738	GTA	2	6	42893	42898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308409
558	NC_019738	AAC	2	6	42921	42926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308409
559	NC_019738	TAC	2	6	43035	43040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308409
560	NC_019738	GAT	2	6	43094	43099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308409
561	NC_019738	GTT	2	6	43176	43181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308409
562	NC_019738	CA	3	6	43338	43343	50 %	0 %	0 %	50 %	428308409
563	NC_019738	GCT	2	6	43352	43357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308409
564	NC_019738	CCT	2	6	43441	43446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308409
565	NC_019738	GACT	2	8	43520	43527	25 %	25 %	25 %	25 %	428308409
566	NC_019738	ATT	2	6	44052	44057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308410
567	NC_019738	AT	3	6	44096	44101	50 %	50 %	0 %	0 %	428308410
568	NC_019738	CTT	2	6	44211	44216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308410
569	NC_019738	CGA	2	6	44276	44281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308410
570	NC_019738	CAA	2	6	44328	44333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308410
571	NC_019738	ATC	2	6	44335	44340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308410
572	NC_019738	TGA	2	6	44342	44347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308410
573	NC_019738	GAA	2	6	44424	44429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308410
574	NC_019738	TCA	2	6	44700	44705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308411
575	NC_019738	CTT	2	6	44752	44757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308411
576	NC_019738	CCG	2	6	44783	44788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308411
577	NC_019738	AAAATA	2	12	44814	44825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428308411
578	NC_019738	ACT	2	6	44868	44873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308411
579	NC_019738	TAG	2	6	44940	44945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308411
580	NC_019738	TCA	2	6	44976	44981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308411
581	NC_019738	GCC	2	6	44982	44987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308411
582	NC_019738	AGT	3	9	45019	45027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308411
583	NC_019738	GTC	2	6	45063	45068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308411
584	NC_019738	GCA	2	6	45115	45120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308411
585	NC_019738	ACG	2	6	45153	45158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308411
586	NC_019738	GCT	2	6	45205	45210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308412
587	NC_019738	GA	3	6	45266	45271	50 %	0 %	50 %	0 %	428308412
588	NC_019738	ATG	2	6	45272	45277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308412
589	NC_019738	TAA	2	6	45291	45296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308412
590	NC_019738	ACG	2	6	45310	45315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308412
591	NC_019738	CGATA	2	10	45418	45427	40 %	20 %	20 %	20 %	428308412
592	NC_019738	T	6	6	45982	45987	0 %	100 %	0 %	0 %	428308413
593	NC_019738	GGC	2	6	46029	46034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308413
594	NC_019738	GCTGA	2	10	46066	46075	20 %	20 %	40 %	20 %	428308413
595	NC_019738	TGA	2	6	46082	46087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308413
596	NC_019738	A	6	6	46186	46191	100 %	0 %	0 %	0 %	428308413
597	NC_019738	GA	3	6	46241	46246	50 %	0 %	50 %	0 %	428308413
598	NC_019738	T	6	6	46273	46278	0 %	100 %	0 %	0 %	428308413
599	NC_019738	AT	3	6	46291	46296	50 %	50 %	0 %	0 %	428308413
600	NC_019738	AAC	2	6	46399	46404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308413
601	NC_019738	AG	3	6	46437	46442	50 %	0 %	50 %	0 %	428308413
602	NC_019738	ATGCT	2	10	46460	46469	20 %	40 %	20 %	20 %	428308413
603	NC_019738	AAT	2	6	46498	46503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308413
604	NC_019738	CAG	2	6	46571	46576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308413
605	NC_019738	TGG	2	6	46627	46632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308413
606	NC_019738	TAG	2	6	46678	46683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308413
607	NC_019738	ACC	2	6	46803	46808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308414
608	NC_019738	CAG	2	6	46813	46818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308414
609	NC_019738	TGA	2	6	46823	46828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308414
610	NC_019738	TACCTT	2	12	46997	47008	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428308414
611	NC_019738	GGCT	2	8	47038	47045	0 %	25 %	50 %	25 %	428308414
612	NC_019738	ATTG	2	8	47060	47067	25 %	50 %	25 %	0 %	428308414
613	NC_019738	CGA	2	6	47103	47108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308414
614	NC_019738	GGT	2	6	47178	47183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308414
615	NC_019738	CAG	2	6	47200	47205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308414
616	NC_019738	GTCC	2	8	47235	47242	0 %	25 %	25 %	50 %	428308414
617	NC_019738	ACC	2	6	47270	47275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308414
618	NC_019738	GTT	2	6	47480	47485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308414
619	NC_019738	CAA	2	6	47496	47501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308414
620	NC_019738	GAA	2	6	47532	47537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308414
621	NC_019738	TAC	2	6	47679	47684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308414
622	NC_019738	CAA	2	6	47700	47705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308414
623	NC_019738	GCA	2	6	47798	47803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308414
624	NC_019738	ACA	2	6	47828	47833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308414
625	NC_019738	CTATCG	2	12	48209	48220	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428308414
626	NC_019738	TTG	2	6	48240	48245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308414
627	NC_019738	CAA	2	6	48254	48259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308414
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